| | |  

         
Quick Menu
   컨텐츠마당
  1. NGIC 컨텐츠
2. GSSHIN 컨텐츠
 
up,down
서비스 >> 데이터마당
   NGIC 컨텐츠 상세정보
    데이터형식   웹사이트
    글쓴이   관리자
    분류체계   비세포생물계 / 문헌체 / 정보서비스 / 검색
    제   목   Korean Articles in PubMed (KoAMed, 코아메드)
    핵심 주제어   KoAMed, 코아메드, PubMed
    참조 웹사이트   http://koamed.kobic.re.kr
    내   용
  1. PubMed 및 KoAMed에 관하여
펍매드(PubMed)는 메드라인 데이터베이스(Medline Database)에 MESH descriptors를 기반으로 작동하며, 비의학적인 일반 과학저널도 포함되어 있는공공 데이터베이스 겸 웹기반 검색엔진이다. 1996년 1월에 미국립보건원 산하 국립의학도서관에서 운영하는 Entrez information retrieval system의 일부로 서비스를 시작했고 National Center for Biotechnology Information에서 관할 하고 있으며 현재 약 2 천만 건이 등록되어 있음. 상세내용 바로가기(PubMed Help) Korean Articles in PubMed, KoAMed(코아메드)는 국내 바이오 및 의학 관련 논문 발표 실적을 객관적인 지표로 비교 분석할만한 데이터가 부족하다는 판단하고, 전세계 바이오-의학 분야 대표적인 문헌 데이터베이스인 PubMed에 등재된 국내 발표 논문을 대상으로 간단하게 비교 분석 할 수있는 서비스를 위해 만든 데이터베이스임. NCBI에서 제공하는 E-utility를 사용해서 PubMed DB에 등재된 각 논문의 제1 저자의 소속 정보에서 "Korea"로 기록된 논문만을 대상으로 분석한 것임. 논문의 제1저자의 소속정보가 부정확하거나 오타 등으로 인해 분류가 어려운 논문이 다수 있어, 각 분류 단체에 대한 matching table을 작성하여 문제를 부분적으로 해결하였으나 판단이 불가한 경우는 미결정, "Suspension"으로 처리함.

2. 시스템 구성 및 흐름도 [ 보기 ]

3. 데이터 및 업데이터
데이터(서비스 대상 논문): 2000년 이후 PubMed에 등재된 논문중 제1저자의 소속 기관이 물리적으로 대한민국에 소재하는 논문을 대상으로 서비스주1) 논문상에 기록된 제1 저자의 소속정보가 부적절하게 작성된 경우 일차로 관리자가 판별 가능한 대상은 수정 보완을 통해 분류 하였으나, 확인 불가한 경우 대상에서 제외됨(Suspension으로 표기)주2) 개칭, 인수합병, 통합 등의 사유로 기관 명칭의 변화가 있는 경우 관리자가 확인한 내용은 최근의 기관 성과물로 등록했으나 확인 못한 부분이 있을 수 있음. (사용중 문제가 있다고 판단되어 연락 주시면 확인 후 즉시 반영함. 연락처: ist@kobic.kr)데이터 수집: NCBI에서 제공하는 E-utility를 사용해서 XML 형태의 데이터를 수집한 후 파서로 문서를 변환하고 데이터 추가 및 편집 과정을 거쳐 MySQL DBMS를 사용해서 KoAMed 데이터 베이스를 구축함 업데이터: 새논문은 하루에 1번씩 PubMed를 검색해서 결과를 KoAMed 데이터베이스에 반영시키며, 국가비교 데이터는 PubMed 등재일(EDAT)을 기준으로 1달에 1회 업데이터 됨

4. 서비스 메뉴
새논문매일 1회 PubMed를 검색해서 새롭게 추가된 국내 발표 논문을 업데이터 함검색(완전 매칭)은 제목/저자/기간/기관명에 따라 제한 검색이 가능하도록 설계 기관은 2000년 이후 1편이상 제1저자로 논문을 발표한 기관으로 관리자가 확인가능한 경우 인수합병이나 기타 개명 등으로 기관명이 변한 경우 현재의 기관명으로 통일 SNS 서비스: 공유하고 싶은 대상 논문을 선택하고 Facebook과 Twitter 이미지를 클릭하면 해당 논문이 공유됨 정렬은 각 논문의 발표일을 기준으로 내림차순으로 정렬되어 있으며, PubMed에서 제공하는 발표일 정보중에 일(date) 정보가 없거나 계절로 표현된 부분은 자체 기준에 따라 수정함 주요논문새로운 논문중 인용지수(Impact Factor)가 5 이상인 저널에 실린 논문을 "주요 논문"으로 정의하고 소개 주) 인용지수가 논문의 가치를 평가할 수 있는 지표는 아니지만 현실적으로 사용할 수 있는 주요 지표이기 때문에 활용하였음단체비교2000년 이후 국내에서 발표된 논문의 제 1저자의 소속 정보를 기준으로 작성됨평균 인용지수는 전체 논문들의 인용지수 합/전체 논문 수로 나눈 값인용지수평균과 논문발표수 항목을 클릭하면 오림차 혹은 내림차로 정렬이 이루어 짐디폴트(default)로 설정된 단체비교의 대상은 논문발표수가 50편 이상인 단체로 한정하였으나 지역이나 기간 혹은 단체속성을 선택하면 전체 대상 기관을 볼 수 있음대표 키워드는 각 논문에 정의된 MESH descriptors를 모아서 가장 많이 사용된 단어 순으로 정리한 것으로 각 단체의 연구대상이나 연구분야를 추정할 수 있음국가비교각 대륙별로 주요 국가를 임의로 선택해서 만들어졌으며, 새로운 국가를 추가하시길 원하시면 언제라도 추가할 수 있음. 연락처: ist@kobic.kr분석 기준일은 PubMed에 등재되는 날짜, Eentrez Date[EDAT]을 기준으로 작성되며, 월1회 업데이터 됨KoA검색주요 데이터베이스별 검색: 전 세계 의학 및 생명과학 주요 데이터베이스를 타겟으로 제공하는 LinkOut 서비스 주요 저널별 검색:PubMed 주요 저널을 선택해서 해당 저널에서만 자료를 검색하는 LinkOut 서비스국가별 검색: 선택된 특정 국가에서 발표(제1 저자 기준)된 논문만을 검색하는 LinkOut 서비스 분석도구 검색:PubMed DB에 포함된 데이터베이스, 분석 툴, 알고리즘등 웹리소스만을 검색하는 LinkOut 서비스

5. 개발자
Programmed by Ji Han, Kim., dnarn@kribb.re.kr
Designed by Eujin, Kwak., wh0321@kribb.re.kr
Organized by Equal Jung., dsjung@kribb.re.kr

     참조 파일
 
    등록날짜   2012-03-17
   
 
엔직(NGIC)  |   검색마당  |   알림마당  |   컨텐츠마당  |   교육공간  |   고객센터  
Copyright © 2011 by . All rights reserved.
(35224) 대전광역시 서구 월평로 94번길 6, 402호 (월평동)
TEL. 070-8875-7391, FAX. 042-488-7377,  E-mail :